Jirou Azuma, seorang remaja berusia tujuh belas tahun, menjalani kehidupan yang tenang bersama kakeknya. Ia memanfaatkan kemampuan supranaturalnya untuk berbicara dengan hewan guna menjalin persahabatan dan melindungi mereka. Baik Jirou maupun kakeknya adalah keturunan dari klan shinobi yang telah lama ada; mereka berlatih bela diri demi melestarikan seni pertarungan dalam keluarga mereka. Kehidupan Jirou berubah drastis setelah ia menyelamatkan seekor kucing hitam yang tampak biasa saja bernama Ragou, namun ternyata kucing itu adalah sesosok *mononoke*—roh iblis yang telah lama bermusuhan dengan umat manusia. Saat seekor *mononoke* jahat datang memburu Ragou, Jirou mengerahkan kemampuan shinobi-nya untuk melindungi kucing tersebut, namun ia justru mengalami luka yang fatal.
Di tengah pilihan untuk melahap sisa energi Jirou demi memulihkan kekuatan penuhnya, Ragou justru memilih untuk memberikan sisa energinya kepada Jirou. Selain menghidupkan kembali pemuda itu, proses transfer energi tersebut juga menganugerahinya kekuatan supranatural dahsyat yang melengkapi gaya bertarung shinobi miliknya. Peristiwa ini disaksikan oleh Ryousuke Shiba, seorang petugas Biro Spionase yang bertugas membasmi *mononoke* agresif. Shiba kemudian menawarkan kesempatan kepada Jirou dan kakeknya untuk bergabung dengan unit baru bentukan Biro tersebut, Black Torch, serta membantu mereka memerangi *mononoke* kuat yang mengincar nyawa orang-orang tak berdosa.
