Setelah Akihito Kanbara bersatu kembali dengan Mirai Kuriyama—yang dia yakini telah menghilang setelah mengalahkan Beyond the Boundary—dia menemukan fakta yang memilukan: Mirai telah kehilangan semua ingatan tentang dirinya, teman-teman mereka, dan masa lalunya sebagai Spirit Warrior. Akihito sangat terpukul, tetapi menyadari bahwa dia memiliki kesempatan unik. Mirai akhirnya bisa menjalani kehidupan sebagai gadis normal—di mana dia akan benar-benar terbebas dari masyarakat supranatural yang dijauhi dan dimanfaatkannya. Meskipun itu semua demi kebahagiaan Mirai, harganya mahal — Akihito dan teman-temannya harus merahasiakan asal usulnya yang sebenarnya darinya, dan akibatnya menghindari berteman dengannya.
Namun, ingatan yang meresahkan dari kehidupan lama Mirai secara bertahap mulai muncul kembali, dan kejahatan baru yang misterius memimpin sekelompok makhluk seperti bayangan ke kota dengan tujuan mencarinya. Saat situasi menjadi mengerikan, Akihito harus berjuang untuk melindungi dirinya sendiri, teman-teman terdekatnya, dan Mirai—si cantik berkacamata yang paling ia sayangi.
