Angin seperti wabah berhembus melintasi hamparan pasir yang gersang di Jepang pasca-apokaliptik. Saat menyapu yang hidup dan yang tidak hidup, hanya karat yang tersisa di belakangnya. Penyebab keadaan bencana dunia diyakini spora jamur. Bisco Akaboshi, yang dikenal sebagai “Jamur Pemakan Manusia”, adalah buronan kriminal pemanah yang panahnya langsung menumbuhkan jamur di mana pun mereka mendarat. Namun, dia sebenarnya adalah “Pelindung Jamur”, seseorang yang menyebarkan jamur untuk memperkaya tanah dan mengembalikannya ke keadaan semula.
Di samping kepiting Akutagawa dan dokter muda Milo Nekoyanagi, Bisco menjelajahi tanah terlantar di Jepang mencari “Sabikui” yang legendaris—jamur obat mujarab yang konon bisa melahap segala bentuk karat.