Enam bulan yang lalu, Sakuta Azusagawa kebetulan bertemu dengan seorang gadis kelinci di perpustakaan. Sejak saat itu, dia sangat bahagia dengan pacarnya: Mai Sakurajima, gadis kelinci yang sama. Namun, kemunculan kembali cinta pertamanya yang misterius, Shouko Makinohara yang sekarang sudah dewasa, menambah kerumitan baru dalam hubungannya dengan Mai. Untuk membuat keadaan menjadi lebih buruk, ia kemudian bertemu Shouko sekolah menengah di rumah sakit, menderita penyakit parah. Secara misterius, bekas luka lamanya mulai berdenyut setiap kali dia berada di dekatnya.
Dengan situasi aneh Shouko yang entah bagaimana berputar di sekelilingnya, Sakuta perlu berdamai dengan perasaannya sendiri yang saling bertentangan, baik atau buruk. Dengan kehidupan seorang gadis di tangannya, apa yang bisa dia lakukan?
