Setelah menyerah pada nasib yang tidak menyenangkan, Kiritsugu Emiya telah meninggalkan tugas Shirou Emiya untuk menyelamatkan umat manusia di tempatnya. Dunia sedang sekarat dan waktu terus berlalu, tetapi ketika keselamatan yang dicari Shirou adalah dengan mengorbankan satu-satunya
keluarga yang tersisa — adik perempuannya — apakah dia masih tega untuk menjalankan tugas ini?
Shirou sekarang ditekan dengan pilihan untuk terus menjadi pahlawan keadilan — atau menjadi orang yang sangat jahat yang telah diikrarkan oleh cita-citanya untuk ditaklukkan. Anak yatim piatu itu sendirian lagi, namun tubuhnya masih terbuat dari pedang. Perang Cawan Suci Kelima sekarang dimulai dengan sumpahnya di bawah salju.